O Programa de Pós-graduação em Biologia Vegetal possui uma única área de concentração, denominada Biologia Vegetal, organizada em duas linhas de pesquisa: Padrões em Biologia Vegetal e Processos em Biologia Vegetal.
Essa organização permite integrar diferentes abordagens da Botânica e da Biologia Vegetal, contemplando estudos sobre diversidade, estrutura, evolução, distribuição, funcionamento, reprodução e interações das plantas. As linhas reúnem projetos desenvolvidos por docentes e discentes do Programa, articulando formação acadêmica, produção científica e compreensão da biodiversidade vegetal.